Les scientifiques ont mis au point une méthode révolutionnaire pour suivre l’alimentation à l’aide de données métagénomiques des selles. Cette approche non invasive et basée sur les données offre une alternative objective aux journaux alimentaires et aux questionnaires traditionnels, qui demeurent la référence en matière d’évaluation du régime alimentaire, mais qui peuvent souffrir de problèmes de déclaration inexacte et de conformité.

La nouvelle méthode, mise au point par des chercheurs de l’Institute for Systems Biology (ISB), s’appelle MEDI (Metagenomic Estimation of Dietary Intake) et détecte l’ADN d’origine alimentaire dans les échantillons de selles afin d’estimer l’apport alimentaire. MEDI exploite la métagénomique des selles, qui consiste à séquencer tout l’ADN présent dans les échantillons fécaux (y compris l’ADN microbien, humain et d’origine alimentaire).

Selon le Dr Christian Diener, auteur principal de l’étude, la recherche en nutrition dépend depuis des décennies de journaux et de questionnaires auto-déclarés, des approches qui exigent un degré élevé d’efforts et de conformité de la part des participants à la recherche. MEDI offre une solution en analysant l’ADN d’origine alimentaire dans les échantillons métagénomiques de l’intestin, offrant ainsi une alternative pratique qui présente une bonne concordance avec les habitudes alimentaires et nutritionnelles connues.

Principales conclusions :

• Une alternative au suivi du régime alimentaire basé sur des questionnaires : Tirant parti d’une base de données de plus de 400 aliments et de plus de 300 milliards de paires de bases d’information génomique, MEDI a détecté avec précision les habitudes alimentaires chez les nourrissons et les adultes, et ce, dans le cadre de deux études d’alimentation contrôlée.
• Lien entre l’apport alimentaire et la nutrition : MEDI convertit le profil d’abondance relative d’aliments spécifiques en profils nutritionnels, en supposant une portion de 100 grammes. Ces profils nutritionnels présentent une bonne concordance avec les données provenant d’études d’alimentation contrôlée.
• Risques pour la santé liés à l’alimentation : Sans journaux alimentaires, MEDI a ciblé les caractéristiques alimentaires liées au syndrome métabolique dans une vaste cohorte clinique.

Selon le Dr Sean Gibbons, professeur agrégé à l’ISB et auteur principal de l’étude, cette dernière représente un grand pas en avant dans la façon dont nous suivons l’alimentation et ses répercussions sur la santé humaine. Grâce aux signatures d’ADN d’origine alimentaire dans les selles, nous disposons maintenant d’un moyen puissant de mesurer l’alimentation et la composition du microbiome à partir du même échantillon, ce qui élargira notre compréhension des forces qui façonnent le microbiome intestinal humain, les réponses nutritionnelles personnalisées et le risque de maladie.

Avec un développement plus poussé, MEDI pourrait transformer la science de la nutrition, les études épidémiologiques et les essais cliniques, permettant aux chercheurs, aux médecins et aux individus de suivre les risques pour la santé liés à l’alimentation avec une facilité sans précédent.