Un biofilm associé à la santé comprend des genres tels que Neisseria, Streptococcus, Actinomyces, Veillonella et Granulicatella.

Les micro-organismes associés à la fois aux caries et aux maladies parodontales sont métaboliquement hautement spécialisés et organisés en biofilms microbiens multispécifiques. La progression de ces maladies implique de multiples interactions microbiennes entraînées par différents facteurs de stress. Dans les caries, l’exposition des biofilms dentaires aux sucres alimentaires et leur fermentation aux acides organiques entraîne une augmentation des proportions d’espèces acidogènes et aciduriques. Dans la gingivite, l’accumulation de plaque à la marge gingivale entraîne une inflammation et une augmentation des proportions d’espèces protéolytiques et souvent anaérobies obligatoirement. Les barrières muqueuses naturelles et la salive sont les principaux mécanismes de défense innés contre l’invasion bactérienne des tissus mous. De même, l’émail et la dentine sont d’importantes barrières des tissus durs au processus carieux. Étant donné que l’état actuel des connaissances suggère que les étiologies des caries et des maladies parodontales sont mutuellement indépendantes, les éléments de l’immunité innée qui semblent contribuer à la résistance aux deux coïncident quelque peu.