Dans une méta-étude, une équipe de chercheurs de l’Institut de biotechnologie environnementale de l’Université technique de Graz a démontré que la consommation de fruits et de légumes contribue positivement à la diversité bactérienne dans l’intestin humain.
La diversité bactérienne dans l’intestin joue un rôle important dans la santé humaine. La question cruciale est toutefois de savoir où se trouvent les sources de cette diversité. On sait qu’une partie importante du microbiome maternel est transmise à l’enfant à la naissance et qu’il en va de même pendant la période d’allaitement, via le lait maternel. D’autres sources restaient à découvrir. Cependant, une équipe dirigée par Wisnu Adi Wicaksono et Gabriele Berg de l’Institut de biotechnologie environnementale de l’Université technologique de Graz (TU Graz) a réussi à prouver que les micro-organismes végétaux des fruits et légumes contribuent au microbiome humain. Ils en font état dans une étude publiée dans la revue Gut Microbes.
Vous êtes ce que vous mangez
Les auteurs ont pu démontrer que la fréquence de la consommation de fruits et légumes et la variété des plantes consommées influencent la quantité de bactéries associées aux fruits et légumes dans l’intestin humain. La petite enfance, en particulier, représente une fenêtre d’opportunité pour la colonisation par des bactéries associées aux plantes. Il a également été démontré que les micro-organismes d’origine végétale ont des propriétés probiotiques et bénéfiques pour la santé.
Un microbiome est l’ensemble des micro-organismes qui colonisent un macro-organisme (humain, animal, végétal) ou une partie de celui-ci, par exemple l’intestin ou un fruit. Si les microbiomes individuels sont de mieux en mieux compris, on sait peu de choses sur leurs liens. « La preuve que les micro-organismes des fruits et légumes peuvent coloniser l’intestin humain a été établie pour la première fois », explique Wisnu Adi Wicaksono, premier auteur de l’étude. Cela suggère que la consommation de fruits et légumes, en particulier dans la petite enfance, a une influence positive sur le développement du système immunitaire au cours des trois premières années de la vie, car le microbiome intestinal se développe pendant cette période. Mais même après cela, une bonne diversité de bactéries intestinales est bénéfique pour la santé et la résilience. « Elle influence tout simplement tout. La diversité influence la résilience de l’organisme dans son ensemble ; une plus grande diversité se traduit par une plus grande résilience », explique Gabriele Berg, directrice de l’institut.
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microbiome360.orgPlusieurs milliards de séquences
Afin de pouvoir déterminer si la consommation de fruits et légumes et de leurs microbiomes entraîne effectivement des changements dans le microbiome intestinal, l’équipe a d’abord créé un catalogue de données sur le microbiome des fruits et légumes, ce qui lui a permis d’attribuer leurs bactéries. Elle a ensuite comparé ces données avec celles, accessibles au public, de deux études sur la flore intestinale. Le projet TEDDY a examiné le développement des bébés dans le cadre d’une étude à long terme et l’American Gut Project a étudié le microbiome intestinal des adultes – les deux projets ont également recueilli des données sur l’alimentation des personnes testées. Au total, les chercheurs disposaient des données du métagénome d’environ 2500 échantillons de selles, qui contenaient chacun entre un et dix millions de séquences – plusieurs milliards de séquences ont ainsi été évaluées. Ce vaste ensemble de données a permis de démontrer la présence de la microflore des fruits et légumes dans l’intestin. Cette preuve constitue un élément essentiel de la démonstration du concept « One Health » de l’OMS, qui associe étroitement la santé humaine, animale et environnementale.
Étude de suivi sur trois continents
Pour approfondir ce lien, Gabriele Berg, de l’Institut de biotechnologie environnementale, travaille déjà, avec des collègues internationaux et dans le cadre du projet HEDIMED financé par l’UE, sur une étude d’intervention dans laquelle des personnes de trois continents mangent exactement la même chose pendant un certain temps, après quoi leurs excrétions sont analysées. Mais au-delà de cette étude, Gabriele Berg voit de nombreux domaines qui pourraient être influencés sur la base des résultats de l’étude. Cela commence par la production alimentaire, car le sol, les engrais et les pesticides influencent le microbiome des plantes. « Les fruits et légumes frais auront toujours le meilleur microbiome ; les entreprises agricoles ou de transformation ont déjà une grande influence à cet égard. Le stockage et la transformation des aliments doivent également être reconsidérés de manière critique », explique M. Berg. En fonction des résultats de l’étude prévue, des applications intéressantes pour les individus pourraient également voir le jour. « Chaque fruit et légume possède un microbiome unique. Peut-être qu’un jour, il sera possible d’élaborer un régime alimentaire personnalisé sur la base de ce microbiome ».
