Les microbes font partie des aliments que nous mangeons et peuvent influencer notre propre microbiome, mais nous savons très peu de choses sur les microbes présents dans nos aliments. Des chercheurs ont récemment développé une base de données du « microbiome alimentaire » en séquençant les métagénomes de 2 533 aliments différents. Ils ont identifié 10 899 microbes associés aux aliments, dont la moitié étaient des espèces auparavant inconnues. Ces microbes représentent environ 3 % du microbiome intestinal des adultes et 56 % de celui des nourrissons, en moyenne.
Méthodologie et résultats
L’étude, publiée le 29 août dans la revue Cell, a séquencé les métagénomes de divers aliments provenant de 50 pays, y compris des produits laitiers, des boissons fermentées et des viandes fermentées. Parmi les 10 899 microbes identifiés, 1 036 étaient des espèces bactériennes et 108 des espèces fongiques. Les aliments similaires avaient tendance à héberger des types de microbes similaires, mais une variation importante a été observée entre les produits laitiers en raison du plus grand nombre de produits laitiers étudiés.
Implications pour la santé et la production alimentaire
Comprendre le microbiome des aliments pourrait avoir des implications importantes pour la santé humaine, car certains microbes que nous consommons pourraient devenir des membres stables de notre microbiome. Cette étude montre que les microbes associés aux aliments constituent environ 3 % du microbiome intestinal des adultes et plus de 50 % du microbiome intestinal des nouveau-nés.
En outre, cette base de données pourrait aider les producteurs alimentaires à améliorer la qualité et la cohérence de leurs produits, et pourrait également être utilisée pour authentifier l’identité et l’origine des aliments locaux. Les régulateurs alimentaires pourraient également utiliser ces informations pour définir quels microbes devraient ou ne devraient pas être présents dans certains types d’aliments.
Conclusion
L’étude représente une avancée majeure dans la compréhension du microbiome alimentaire et son impact potentiel sur la santé humaine. Les chercheurs prévoient de poursuivre l’exploration de la diversité des microbiomes alimentaires en fonction des différents aliments, cultures, modes de vie et populations.
Cette recherche ouvre la voie à de nouvelles études sur la façon dont les propriétés microbiennes des aliments pourraient affecter notre santé et notre bien-être.