Selon une étude publiée par des scientifiques de l’Agricultural Research Service et leurs collègues dans la revue mBio, les adultes en bonne santé qui ont une alimentation diversifiée comprenant au moins 8 à 10 grammes de fibres solubles par jour ont moins de microbes résistants aux antibiotiques dans leurs intestins.
Les microbes qui présentent une résistance à divers antibiotiques couramment utilisés, tels que la tétracycline et les aminoglycosides, constituent une source de risque importante pour les populations du monde entier, et l’on s’attend généralement à ce que le problème de la résistance aux antimicrobiens (RAM) – terme qui désigne les bactéries, les virus et les champignons qui résistent aux antibiotiques – s’aggrave au cours des prochaines décennies.
La résistance aux antimicrobiens chez l’homme repose en grande partie sur le microbiome intestinal, où l’on sait que les microbes sont porteurs de stratégies génétiquement codées pour survivre au contact des antibiotiques.
« Et les résultats conduisent directement à l’idée que la modification du régime alimentaire pourrait être une nouvelle arme dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens. Et nous ne parlons pas non plus d’un régime alimentaire exotique, mais d’un régime diversifié, adéquat en fibres, que certains Américains consomment déjà », a expliqué Danielle Lemay, biologiste moléculaire de l’ARS Western Human Nutrition Research Center à Davis, en Californie, et responsable de l’étude.
Dans cette étude, les chercheurs ont cherché des associations spécifiques des niveaux de gènes de résistance aux antibiotiques dans les microbes de l’intestin humain avec les fibres et les protéines animales dans les régimes alimentaires des adultes.
Les chercheurs ont constaté que le fait de suivre régulièrement un régime alimentaire comportant des niveaux plus élevés de fibres et des niveaux plus faibles de protéines, notamment de bœuf et de porc, était significativement corrélé à des niveaux plus faibles de gènes de résistance aux antibiotiques (ARG) dans les microbes intestinaux. Les personnes dont le microbiome intestinal présentait les plus faibles niveaux de gènes ARG avaient également une plus grande abondance de microbes anaérobies stricts, c’est-à-dire de bactéries qui ne se développent pas en présence d’oxygène et qui sont la marque d’un intestin sain et peu inflammatoire. Les espèces bactériennes de la famille des Clostridiaceae étaient les anaérobies les plus nombreuses.
Cependant, la quantité de protéines animales dans le régime alimentaire n’était pas un facteur prédictif important de niveaux élevés d’ARG. La preuve la plus solide est l’association d’une plus grande quantité de fibres solubles dans le régime alimentaire avec des niveaux plus faibles d’ARG.
« Étonnamment, le facteur prédictif le plus important de faibles niveaux d’ARG, plus encore que les fibres, était la diversité du régime alimentaire. Cela suggère que nous pourrions vouloir manger à partir de sources diverses d’aliments qui ont tendance à être plus riches en fibres solubles pour en tirer le maximum de bénéfices », a ajouté Mme Lemay.
Les fibres solubles, comme leur nom l’indique, se dissolvent dans l’eau et constituent le principal type de fibres que l’on trouve dans les céréales comme l’orge et l’avoine, les légumineuses comme les haricots, les lentilles et les pois, les graines (comme les graines de chia) et les noix, ainsi que dans certains fruits et légumes comme les carottes, les baies, les artichauts, les brocolis et les courges d’hiver.
À l’inverse, les personnes dont le microbiome intestinal présentait les niveaux les plus élevés d’ARG avaient un microbiome intestinal nettement moins diversifié que les groupes présentant des niveaux faibles ou moyens d’ARG.
« Notre régime alimentaire fournit de la nourriture aux microbes intestinaux. Tout cela suggère que ce que nous mangeons pourrait être une solution pour réduire la résistance aux antimicrobiens en modifiant le microbiome intestinal », a déclaré M. Lemay.
Au total, 290 adultes en bonne santé ont participé à l’étude.
« Mais ce n’est encore qu’un début car ce que nous avons fait était une étude d’observation plutôt qu’une étude dans laquelle nous avons fourni un régime alimentaire particulier aux sujets, ce qui permettrait davantage de comparaisons directes », a déclaré Lemay. « En fin de compte, les interventions diététiques peuvent être utiles pour réduire le fardeau de la résistance aux antimicrobiens et pourraient finalement motiver des directives diététiques qui examineront comment la nutrition pourrait réduire le risque d’infections résistantes aux antibiotiques. »